虽然微软将Windows Server和Hyper-V的主要用户锁定为Windows客户端，但是Windows Server 2012 R2将在更大程度上支持Linux客户端，特别是对于运行Linux的Hyper-V虚拟机来说。

在Hyper-V虚拟机内部运行Linux的可能性一直存在，但是Linux VM的等级不如Windows VM。很多Hyper-V特性只支持Windows VM，最好的例子是Hyper-V动态内存。

但是现在，微软Hyper-V的焦点正在发生变化。

Windows Server 2012 R2被称作云操作系统，微软希望Windows Server 2012 R2 Hyper-V是最好的运行Linux的云平台。为了实现这个目标，微软赋予了hypervisor更好的支持异构OS的能力，提升了Linux VM的级别。

Linux集成服务改变了这场游戏

微软的集成服务令一些Hyper-V特性只支持Windows VM，相当于VMware Tools。集成服务允许客机OS更好地与hypervisor交互。之前的Hyper-V版本只包含了Windows VM相关的集成服务。

Linux集成服务被添加到Linux内核源代码中，从而增加并加深了对Linux VM的支持。很多Linux版本都将获此支持，包括红帽、Ubuntu和SUSE。

Linux VM支持动态备份

Linux集成服务现在可允许Linux VM访问大量的Hyper-V特性。Linux VM将最终能够利用Hyper-V动态内存。Hyper-V动态内存允许组织能够在他们的Hyper-V主机上实现更高密度的Linux VM。

另外一个重要的改进是，Linux VM将支持动态备份，允许公司无中断备份动态Linux VM。该过程建立在使用与文件系统一致的底层虚拟硬盘的快照的基础之上。该功能基于hypervisor，但微软还将通过自己的产品支持Linux备份。Windows服务器备份将能够备份动态VM；System Center 2012 R2数据保护管理器将包含Linux备份功能。

Windows Server 2012 Hyper-V还将支持动态虚拟机上的虚拟硬盘扩展。尽管该特性甚至对于Windows VM来说都是新的，但其将支持Linux。

虽然大多数Hyper-V特性对Linux客机可用，但并不是所有的功能都支持Linux。例如，新的第二代虚拟机并不支持Linux。第二代虚拟机只支持Windows 8、Windows 8.1、Windows Server 2012和Windows Server 2012 R2上运行的VM。

虽说Hyper-V提升了Linux VM支持，但对Linux的支持并不限于Hyper-V。微软希望Hyper-V成为最佳的Linux云平台。为了实现这一目标，他们在System Center 2012 R2产品中也增加了Linux支持功能。这意味着，可以只通过一个界面来创建、管理和备份Linux和WindowsVM。更重要的是，这种改变意味着System Center和Hyper-V都将完全支持Linux。